Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 1700028K03Rik-201ENSMUST00000058921 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Mir146b-201ENSMUST00000093619 109 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 2310069B03Rik-202ENSMUST00000186147 1833 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Wdr27-206ENSMUST00000228330 2759 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Satb1-203ENSMUST00000129667 2896 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm45477-201ENSMUST00000200213 5498 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm23131-201ENSMUST00000104253 132 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Mir467f-201ENSMUST00000116923 120 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm14528-201ENSMUST00000120615 231 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm5327-201ENSMUST00000182864 1009 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm27435-201ENSMUST00000183588 88 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Scgb2b10-201ENSMUST00000191403 318 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm37108-201ENSMUST00000194605 626 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm43674-201ENSMUST00000196313 791 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm44764-202ENSMUST00000204912 671 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm30771-201ENSMUST00000205683 737 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm7482-201ENSMUST00000206446 505 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC122360.1-201ENSMUST00000217737 624 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Olfr1179-201ENSMUST00000099825 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 A230001M10Rik-202ENSMUST00000196720 1307 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RxraP28700 9230112J17Rik-201ENSMUST00000216749 2333 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm10651-201ENSMUST00000118212 609 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm28609-201ENSMUST00000186515 463 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm28677-202ENSMUST00000186904 615 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC125543.2-201ENSMUST00000222114 105 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 CT030170.7-201ENSMUST00000223372 103 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 H2al1m-201ENSMUST00000073949 535 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Olfr698-201ENSMUST00000074981 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 A630001G21Rik-201ENSMUST00000064788 1353 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Skap1-201ENSMUST00000071510 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Tead1-206ENSMUST00000164363 1495 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC122878.1-201ENSMUST00000227716 1460 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Cd247-208ENSMUST00000178336 2807 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Rnf141-209ENSMUST00000177236 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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