Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Tmsb10-204ENSMUST00000144337 433 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm28864-201ENSMUST00000189251 644 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm36550-201ENSMUST00000221947 416 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 D3Ertd751e-207ENSMUST00000146165 3574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm15324-201ENSMUST00000139397 355 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Ntpcr-208ENSMUST00000152189 822 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm14061-201ENSMUST00000155923 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Apoc1-204ENSMUST00000207978 339 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Olfr960-203ENSMUST00000216584 1148 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 AC130829.2-201ENSMUST00000222931 127 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 AC160931.1-201ENSMUST00000223298 413 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 AC129975.2-201ENSMUST00000223705 775 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm34297-201ENSMUST00000218569 1980 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm13254-201ENSMUST00000118295 654 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm12875-201ENSMUST00000118745 344 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms