Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm11756-201ENSMUST00000107310 1312 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Ocln-202ENSMUST00000069756 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Prepl-201ENSMUST00000072406 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Tmem209-203ENSMUST00000115157 2273 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Cnpy1-203ENSMUST00000120068 2284 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Stx8-202ENSMUST00000021286 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm40603-202ENSMUST00000219975 1642 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Creb1-201ENSMUST00000049932 5009 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Kng1-203ENSMUST00000089902 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Nr6a1-201ENSMUST00000076275 5941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Olfr329-ps-202ENSMUST00000108823 1060 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Pcna-ps1-201ENSMUST00000118453 738 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm15585-201ENSMUST00000149696 670 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm15938-201ENSMUST00000150079 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm4287-201ENSMUST00000174329 585 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm7132-201ENSMUST00000182302 984 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm7191-201ENSMUST00000182678 990 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm27406-201ENSMUST00000184881 182 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm28126-201ENSMUST00000185286 356 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm28421-201ENSMUST00000186378 356 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm28212-201ENSMUST00000187114 356 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm28355-201ENSMUST00000187443 356 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm29568-201ENSMUST00000187884 356 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm29080-201ENSMUST00000188565 356 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm28944-201ENSMUST00000188946 356 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm28908-201ENSMUST00000189002 356 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm29078-201ENSMUST00000190611 356 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm6394-201ENSMUST00000197077 477 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm30835-201ENSMUST00000198825 689 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Plut-203ENSMUST00000201192 569 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm8479-202ENSMUST00000204366 1070 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm38405-201ENSMUST00000207760 1140 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 0610005C13Rik-211ENSMUST00000211530 402 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 4930477N07Rik-201ENSMUST00000218762 614 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 AC126691.2-201ENSMUST00000226185 249 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Psors1c2-201ENSMUST00000025273 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Zfp473-201ENSMUST00000060270 3800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm26003-201ENSMUST00000083061 113 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Tac1-201ENSMUST00000090679 980 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Olfr155-201ENSMUST00000095108 1172 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 A730049H05Rik-201ENSMUST00000057977 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Spx-204ENSMUST00000211094 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm28791-201ENSMUST00000185888 1779 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm9903-201ENSMUST00000181102 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Pax9-201ENSMUST00000001538 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Aldoart1-202ENSMUST00000179234 2050 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm26012-201ENSMUST00000104411 128 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm23835-201ENSMUST00000104439 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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