Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Trpc7-202ENSMUST00000109871 3519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Pcdhga1-202ENSMUST00000194888 3247 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Stat1-212ENSMUST00000191435 2803 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Fam229b-203ENSMUST00000125042 707 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Fam229b-206ENSMUST00000136546 592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm8266-201ENSMUST00000179745 1192 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm12117-201ENSMUST00000183831 456 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Olfr120-201ENSMUST00000077498 993 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Enox2-205ENSMUST00000114918 3226 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Alox8-201ENSMUST00000021262 3226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Igsf9b-204ENSMUST00000214357 16144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Adgrg1-202ENSMUST00000179619 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 B3gntl1-202ENSMUST00000067399 2864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Rps6ka1-205ENSMUST00000157067 2637 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Pde10a-201ENSMUST00000024647 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 AC122397.1-201ENSMUST00000228650 2819 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Dync1i2-207ENSMUST00000112142 2585 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Spen-201ENSMUST00000078886 12082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Slc6a16-203ENSMUST00000213347 2865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Fgd3-201ENSMUST00000048716 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Hmgcs2-201ENSMUST00000090746 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm35048-201ENSMUST00000192105 2802 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Rcan2-201ENSMUST00000044792 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Ikbkap-201ENSMUST00000030140 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm13548-201ENSMUST00000144688 385 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm18697-201ENSMUST00000191179 2126 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm5539-201ENSMUST00000192177 966 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm2163-201ENSMUST00000179734 2723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Scml4-202ENSMUST00000105494 4166 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Snapc4-202ENSMUST00000114115 4368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Parva-203ENSMUST00000106643 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Egflam-201ENSMUST00000058593 4778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Myom1-203ENSMUST00000179759 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Cast-201ENSMUST00000065629 2910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm45629-201ENSMUST00000209629 2546 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Slc26a8-201ENSMUST00000114764 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Tmem268-202ENSMUST00000080336 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Srgap1-202ENSMUST00000081688 7787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Chd7-202ENSMUST00000051558 10216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 4930402H05Rik-201ENSMUST00000203115 2829 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Lrrc1-201ENSMUST00000113421 2630 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm37843-201ENSMUST00000195213 2639 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Olfr549-202ENSMUST00000217478 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Mas1-201ENSMUST00000089015 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Ttc16-201ENSMUST00000066478 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Khdc1b-201ENSMUST00000147615 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm35608-201ENSMUST00000218472 2370 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm14099-201ENSMUST00000117769 605 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 AC132304.1-201ENSMUST00000218860 135 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms