Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm44151-201ENSMUST00000204704 259 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 1700018P08Rik-201ENSMUST00000212522 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm9280-201ENSMUST00000223155 517 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Serpina3f-202ENSMUST00000121337 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm10302-201ENSMUST00000174433 3535 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 D630033O11Rik-205ENSMUST00000210802 2761 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Msh4-205ENSMUST00000190449 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm6368-201ENSMUST00000119727 2147 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gria4-201ENSMUST00000027020 5441 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Xpnpep3-201ENSMUST00000041609 3236 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Prr5l-209ENSMUST00000163762 4159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 A930104D05Rik-201ENSMUST00000128601 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm43544-201ENSMUST00000196474 2472 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm17995-201ENSMUST00000209266 530 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 D7Ertd443e-201ENSMUST00000094002 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Mapk14-203ENSMUST00000114752 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Serpina3f-201ENSMUST00000101080 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Phc2-203ENSMUST00000106080 3885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Cwc22-201ENSMUST00000065889 3471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Mynn-201ENSMUST00000047502 3394 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Arpp21-201ENSMUST00000035085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Nbr1-204ENSMUST00000107208 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Plat-201ENSMUST00000033941 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 4930543N07Rik-201ENSMUST00000209357 1364 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CenpfE9Q3P4 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms