Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Fkbp14-201ENSMUST00000046520 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Ablim1-203ENSMUST00000104902 5907 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Satb1-203ENSMUST00000129667 2896 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Nos1-207ENSMUST00000171055 4388 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Syt11-201ENSMUST00000090945 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Aldh1l1-203ENSMUST00000130418 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Ogdhl-203ENSMUST00000228529 3723 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Naa11-201ENSMUST00000060265 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm44684-201ENSMUST00000205388 2926 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Prox2-202ENSMUST00000177289 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 4930407I10Rik-201ENSMUST00000100396 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Nemp1-201ENSMUST00000048099 6002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Mapk14-203ENSMUST00000114752 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Nfat5-214ENSMUST00000169453 13380 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Slc2a3-201ENSMUST00000032476 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm13243-201ENSMUST00000117481 565 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Amd-ps4-201ENSMUST00000118392 1003 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm13240-201ENSMUST00000120042 565 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm16188-201ENSMUST00000142019 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Ccdc127-203ENSMUST00000160021 2682 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 D6Wsu163e-201ENSMUST00000032497 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm12258-201ENSMUST00000093768 2524 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Serpina1a-201ENSMUST00000072876 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Zfp638-201ENSMUST00000032088 6199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Creb1-202ENSMUST00000087366 8364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Cops2-203ENSMUST00000110463 3392 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms