Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 9230112J17Rik-201ENSMUST00000216749 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Tyms-201ENSMUST00000026846 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Ttll1-203ENSMUST00000109480 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Cilp-201ENSMUST00000048762 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 6430562O15Rik-202ENSMUST00000180808 3997 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Slc13a2os-201ENSMUST00000149865 3627 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Supt20-203ENSMUST00000197502 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Arhgap4-205ENSMUST00000114407 3051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 C5ar2-202ENSMUST00000171425 3381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 B430010I23Rik-201ENSMUST00000123703 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 D5Ertd615e-202ENSMUST00000197016 3911 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm16130-201ENSMUST00000153106 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Elp3-203ENSMUST00000225355 2771 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Emc1-205ENSMUST00000179784 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Epb42-202ENSMUST00000102490 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gpkow-201ENSMUST00000049896 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ccdc18Q640L5 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ccdc18Q640L5 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ccdc18Q640L5 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Ece2-207ENSMUST00000079600 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ccdc18Q640L5 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Eif2ak4-205ENSMUST00000110872 4907 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Zdhhc22-202ENSMUST00000222543 3462 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Tnfsf15-201ENSMUST00000062246 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Ece2-208ENSMUST00000120394 3432 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm44684-201ENSMUST00000205388 2926 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 A830010M20Rik-201ENSMUST00000060553 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Ndst3-207ENSMUST00000172537 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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