Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm43776-201ENSMUST00000199729 2914 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Pcm1-201ENSMUST00000045218 6624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Aldh3b3-202ENSMUST00000179433 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 5430427N15Rik-201ENSMUST00000200007 2393 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Tmem175-202ENSMUST00000078323 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Cnga2-201ENSMUST00000006020 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Rab27a-203ENSMUST00000184146 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Col15a1-204ENSMUST00000107731 3253 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Armcx2-207ENSMUST00000168264 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Kcnj3-202ENSMUST00000112632 4068 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Gria3-201ENSMUST00000076349 5192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Rps6ka1-205ENSMUST00000157067 2637 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Tfcp2l1-201ENSMUST00000027629 9269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Cdhr2-201ENSMUST00000037145 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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Znf48Q3US17 Trim9-203ENSMUST00000167755 4559 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Armc9-202ENSMUST00000113309 3555 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Tsga10-208ENSMUST00000193669 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Etfbkmt-204ENSMUST00000111551 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Etfbkmt-201ENSMUST00000047531 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Trim36-201ENSMUST00000037011 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 9130230L23Rik-203ENSMUST00000201351 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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Znf48Q3US17 Defb20-201ENSMUST00000109836 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Cuta-202ENSMUST00000114935 597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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Znf48Q3US17 Hsd17b3-204ENSMUST00000222783 1184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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Znf48Q3US17 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Sprr1a-201ENSMUST00000054599 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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Znf48Q3US17 Mir181c-201ENSMUST00000083549 89 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Prickle2-202ENSMUST00000113445 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Zfp142-202ENSMUST00000066986 5756 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Catspere1-201ENSMUST00000194528 2949 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Bank1-203ENSMUST00000196159 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Dync1i2-203ENSMUST00000112136 2548 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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