Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 AC153955.4-201ENSMUST00000217069 2752 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Arpp21-201ENSMUST00000035085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Rian-202ENSMUST00000181253 2355 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm43080-201ENSMUST00000199006 2643 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Rbm28-201ENSMUST00000007993 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 E230020D15Rik-201ENSMUST00000208097 5899 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Pigr-201ENSMUST00000027675 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Myom1-203ENSMUST00000179759 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gys2-201ENSMUST00000032371 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Phc2-203ENSMUST00000106080 3885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gigyf2-217ENSMUST00000174501 3876 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Dnajb5-202ENSMUST00000084662 3302 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm15286-201ENSMUST00000150623 743 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Acer2-201ENSMUST00000045224 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Chd7-202ENSMUST00000051558 10216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Prkrip1-204ENSMUST00000151786 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 F10-202ENSMUST00000063820 2503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Lrrc32-201ENSMUST00000165205 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Myo7b-201ENSMUST00000134663 6621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Sycp1-202ENSMUST00000196988 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Pla2g4d-201ENSMUST00000094665 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms