Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Ighv2-4-201ENSMUST00000103447 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm26012-201ENSMUST00000104411 128 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm11621-201ENSMUST00000118253 589 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm12170-201ENSMUST00000119281 300 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm3275-201ENSMUST00000169145 487 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 2810429I04Rik-204ENSMUST00000185835 923 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm18353-201ENSMUST00000185906 784 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 2210420H20Rik-201ENSMUST00000188435 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm37623-201ENSMUST00000193691 803 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 4930553I04Rik-201ENSMUST00000196722 670 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm7482-201ENSMUST00000206446 505 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm45155-201ENSMUST00000207365 596 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm45274-201ENSMUST00000209938 647 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Chmp2a-204ENSMUST00000211344 606 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Chmp2a-206ENSMUST00000211626 726 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm7850-201ENSMUST00000212909 712 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC155259.1-201ENSMUST00000214794 477 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1270-201ENSMUST00000099754 1018 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm9105-201ENSMUST00000120160 1398 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Hsf2bp-201ENSMUST00000002145 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Kctd16-201ENSMUST00000091927 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Cxcl5-201ENSMUST00000031318 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm12098-201ENSMUST00000118277 508 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm15343-201ENSMUST00000136382 640 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Cul1-203ENSMUST00000143941 530 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm16585-201ENSMUST00000161442 610 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 A530032D15Rik-203ENSMUST00000161724 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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