Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Glcci1-202ENSMUST00000161217 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 AC112265.1-201ENSMUST00000213522 1501 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Satb1-203ENSMUST00000129667 2896 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm5915-201ENSMUST00000116136 454 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm13921-201ENSMUST00000119411 463 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm11955-201ENSMUST00000119801 470 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm8865-201ENSMUST00000125697 430 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Rpl29-203ENSMUST00000150576 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Mir7230-201ENSMUST00000195977 56 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm43840-201ENSMUST00000199444 484 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm44451-201ENSMUST00000203767 483 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Mcee-204ENSMUST00000206882 391 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm33037-201ENSMUST00000217927 642 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm35035-201ENSMUST00000218838 628 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Olfr1226-201ENSMUST00000099790 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Gc-201ENSMUST00000049209 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Acp1-201ENSMUST00000062740 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Gm26920-201ENSMUST00000182746 2374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Gm16409-201ENSMUST00000100510 747 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Rps6-ps4-201ENSMUST00000118499 750 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Gm8172-201ENSMUST00000120762 750 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Gm14414-201ENSMUST00000120833 573 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm21863J3KMP8 Olfr457-201ENSMUST00000170504 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms