Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Galk2-201ENSMUST00000028636 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Ttc29-201ENSMUST00000049395 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Vmn2r96-202ENSMUST00000177244 1995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 D630039A03Rik-201ENSMUST00000063816 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Grb10-203ENSMUST00000109654 4755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm4279-201ENSMUST00000154314 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Pilrb2-201ENSMUST00000164886 1807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Sp100-210ENSMUST00000147552 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Xlr5c-202ENSMUST00000114503 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Adgrf4-203ENSMUST00000167993 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ube3bQ9ES34 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 4930524O08Rik-202ENSMUST00000184444 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Bbs9-211ENSMUST00000150395 3425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ube3bQ9ES34 Arhgdib-203ENSMUST00000111892 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ube3bQ9ES34 4833417C18Rik-201ENSMUST00000146868 1269 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ube3bQ9ES34 Smpd4-209ENSMUST00000165363 3046 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ube3bQ9ES34 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ube3bQ9ES34 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm6394-201ENSMUST00000197077 477 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ube3bQ9ES34 Gm7850-201ENSMUST00000212909 712 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 AC167019.4-201ENSMUST00000226494 1070 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms