Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Fmnl1-203ENSMUST00000107027 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Glt8d2-201ENSMUST00000020485 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Olfr958-202ENSMUST00000215505 3514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm4673-201ENSMUST00000181395 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Lrtm2-202ENSMUST00000112756 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Tmem181b-ps-202ENSMUST00000180035 2426 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm14200-201ENSMUST00000122256 192 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm12158-201ENSMUST00000130493 631 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm43366-201ENSMUST00000199829 2655 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Olfr523-203ENSMUST00000213953 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Abcc8-201ENSMUST00000033123 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm45062-201ENSMUST00000162564 5842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Cks1brt-201ENSMUST00000076896 2301 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 D830032E09Rik-203ENSMUST00000189845 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Lpin3-203ENSMUST00000109456 3470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm37978-201ENSMUST00000194736 2915 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Bbs9-211ENSMUST00000150395 3425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Olfr531-202ENSMUST00000216053 2330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Col19a1-201ENSMUST00000051344 3336 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Myo6-212ENSMUST00000184480 4139 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Cdh5-201ENSMUST00000034339 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Il10ra-201ENSMUST00000034594 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Hk1-203ENSMUST00000116238 3851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Olfr632-203ENSMUST00000214711 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Olfr1221-202ENSMUST00000143255 2800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Ldb2-201ENSMUST00000070748 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm2163-201ENSMUST00000179734 2723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Tro-207ENSMUST00000163969 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Zfp260-201ENSMUST00000050735 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Acox3-202ENSMUST00000068947 3976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Olfr467-202ENSMUST00000208563 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Olfr467-203ENSMUST00000214253 1855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Nol11-201ENSMUST00000018577 3158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Rgs9-203ENSMUST00000106704 3464 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms