Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Brcc3-201ENSMUST00000033544 4310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm30557-201ENSMUST00000203764 349 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms