Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Cep112-216ENSMUST00000182729 2850 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Idi2-201ENSMUST00000038598 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Nrxn3-201ENSMUST00000057634 4634 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Bcas3-205ENSMUST00000108061 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Dhx30-202ENSMUST00000111991 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm29681-201ENSMUST00000198696 4233 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gfpt2-201ENSMUST00000020629 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Usp3-202ENSMUST00000098613 2797 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 D7Bwg0826e-201ENSMUST00000208484 3795 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Tyrp1-201ENSMUST00000006151 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm16433-201ENSMUST00000062429 1984 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Dhx30-204ENSMUST00000196171 3885 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm26902-201ENSMUST00000181307 3100 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Tfcp2l1-201ENSMUST00000027629 9269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Arhgef9-210ENSMUST00000182001 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Pcdhga2-201ENSMUST00000193869 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Rasgrf2-201ENSMUST00000099326 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Nr1i3-208ENSMUST00000155126 2980 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Supt20-203ENSMUST00000197502 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Ndst2-205ENSMUST00000225000 3661 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm44503-201ENSMUST00000149692 4383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gpatch2-206ENSMUST00000160471 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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