Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Lrcol1-201ENSMUST00000100924 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Mettl8-205ENSMUST00000121586 1151 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm13673-201ENSMUST00000122056 531 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm16150-201ENSMUST00000127620 437 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Cul1-203ENSMUST00000143941 530 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Banf2os-202ENSMUST00000145504 386 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Crem-229ENSMUST00000151084 957 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm37108-201ENSMUST00000194605 626 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm44203-201ENSMUST00000203134 307 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm44451-201ENSMUST00000203767 483 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm44725-201ENSMUST00000205307 391 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 AC123069.1-201ENSMUST00000215094 824 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm40638-201ENSMUST00000216422 682 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 AC159312.1-201ENSMUST00000221508 856 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 AC134917.3-201ENSMUST00000222057 1283 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Olfr1402-201ENSMUST00000060912 963 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Olfr5-201ENSMUST00000086318 1044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Slc17a6-201ENSMUST00000032710 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Naip1-202ENSMUST00000221727 1968 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Olfr704-201ENSMUST00000080925 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Serpina3k-201ENSMUST00000043058 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 AC099612.1-201ENSMUST00000226318 1636 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Olfr621-ps1-201ENSMUST00000119741 938 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Kcnab3os-201ENSMUST00000136196 566 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Asb4-202ENSMUST00000183358 1143 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 1700025H01Rik-201ENSMUST00000187479 547 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 4930474B08Rik-201ENSMUST00000194161 837 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Mark4-ps-201ENSMUST00000196140 384 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm44588-201ENSMUST00000208401 545 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Thyn1-201ENSMUST00000039161 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
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Sh3bp1P55194 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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Sh3bp1P55194 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm44187-201ENSMUST00000204735 1929 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Olfr1491-202ENSMUST00000214007 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Olfr1491-203ENSMUST00000215493 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Olfr1491-205ENSMUST00000216377 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm15283-201ENSMUST00000125308 1451 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Ucn3-201ENSMUST00000058610 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Nrg4-213ENSMUST00000164721 1927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Mup1-202ENSMUST00000103012 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm26012-201ENSMUST00000104411 128 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Mup16-202ENSMUST00000107483 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Cd59b-203ENSMUST00000111131 555 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Pinlyp-201ENSMUST00000011776 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Atp5k-202ENSMUST00000118632 272 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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