Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm6695-201ENSMUST00000177264 1172 ntBASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm3252-202ENSMUST00000178748 450 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm42525-201ENSMUST00000196257 527 ntBASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm43461-201ENSMUST00000202351 996 ntBASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 AC153845.1-201ENSMUST00000213596 428 ntBASIC7□□□□□ -1.29
P20040 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 AC163295.2-202ENSMUST00000227763 1053 ntBASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm4953-201ENSMUST00000077309 483 ntBASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Mir486-201ENSMUST00000093576 128 ntBASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm16701-201ENSMUST00000181309 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 CT025600.1-202ENSMUST00000220264 2510 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm26561-201ENSMUST00000180743 1413 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Adam2-201ENSMUST00000022618 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Slc18b1-201ENSMUST00000119597 2837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 2310001H17Rik-202ENSMUST00000181238 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Neurod1-201ENSMUST00000041099 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm25762-201ENSMUST00000103984 132 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm5530-201ENSMUST00000117185 985 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm11207-201ENSMUST00000117824 414 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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P20040 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm4907-202ENSMUST00000163718 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm17572-201ENSMUST00000171455 420 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm24307-201ENSMUST00000178512 101 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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P20040 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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P20040 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm37623-201ENSMUST00000193691 803 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm6236-201ENSMUST00000193785 1009 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm19148-201ENSMUST00000197045 429 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 4930557K07Rik-201ENSMUST00000205110 363 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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P20040 Tex21-201ENSMUST00000021453 2137 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm8767-201ENSMUST00000215786 1070 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 AL645704.1-201ENSMUST00000221642 604 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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P20040 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Olfr1286-201ENSMUST00000099617 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Lgals9-202ENSMUST00000108268 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm16429-201ENSMUST00000179824 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm37675-201ENSMUST00000192303 2847 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
P20040 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
P20040 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
P20040 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
P20040 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
P20040 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
P20040 Pcdhga1-202ENSMUST00000194888 3247 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
P20040 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
P20040 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
P20040 Gm15999-201ENSMUST00000127317 1511 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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