Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
DmdP11531 Zg16-202ENSMUST00000205424 682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
DmdP11531 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
DmdP11531 4930542C16Rik-201ENSMUST00000062438 1090 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
DmdP11531 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
DmdP11531 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
DmdP11531 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
DmdP11531 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
DmdP11531 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Mpp2-201ENSMUST00000017458 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Adhfe1-203ENSMUST00000144177 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Gm43071-201ENSMUST00000197233 2032 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 F630040K05Rik-201ENSMUST00000180519 2841 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Tomm40l-201ENSMUST00000005817 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Arsj-201ENSMUST00000093976 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Zfp677-202ENSMUST00000162659 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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DmdP11531 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Tnfsf8-201ENSMUST00000030047 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Sun3-201ENSMUST00000043377 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Il1rap-201ENSMUST00000023156 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 Sdr42e1-201ENSMUST00000037955 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
DmdP11531 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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DmdP11531 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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DmdP11531 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 AC125543.2-201ENSMUST00000222114 105 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 CT030170.7-201ENSMUST00000223372 103 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Me1-202ENSMUST00000185374 3292 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Gm20518-201ENSMUST00000150068 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Uhrf1-201ENSMUST00000001258 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Phactr4-203ENSMUST00000102568 4614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Gm37649-201ENSMUST00000192079 2232 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Nme8-201ENSMUST00000039340 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DmdP11531 Magi2-215ENSMUST00000208219 3266 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms