Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC107369.2-201ENSMUST00000226154 916 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC156790.4-202ENSMUST00000228838 1418 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Hdac9-203ENSMUST00000209667 1635 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 4933430I17Rik-201ENSMUST00000062145 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm22268-201ENSMUST00000104009 131 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Ppp1r2-ps4-201ENSMUST00000112182 633 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm16365-201ENSMUST00000122987 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm11635-202ENSMUST00000139424 472 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Mir5135-201ENSMUST00000174997 79 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Tnfaip8-213ENSMUST00000180305 369 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm5710-201ENSMUST00000183020 995 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm20844-201ENSMUST00000186101 654 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm20921-201ENSMUST00000188265 652 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 1700083H02Rik-201ENSMUST00000190526 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm17909-201ENSMUST00000207587 907 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm43154-209ENSMUST00000209659 1165 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Calb2-202ENSMUST00000212297 1080 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC121788.2-201ENSMUST00000218284 1255 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Olfr371-202ENSMUST00000218663 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC116390.1-201ENSMUST00000227975 670 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Olfr380-201ENSMUST00000075532 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Cldn34b1-201ENSMUST00000096852 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Psg19-201ENSMUST00000004657 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC135083.1-201ENSMUST00000227773 1331 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Olfr444-202ENSMUST00000204092 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms