Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm44249-201ENSMUST00000204538 1805 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Trav12-1-201ENSMUST00000103650 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Aph1b-202ENSMUST00000113730 682 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Gm12310-201ENSMUST00000118013 492 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Bdh2-202ENSMUST00000120397 1172 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 4930401O10Rik-201ENSMUST00000128489 787 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 E330017L17Rik-202ENSMUST00000139190 861 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Gm24362-201ENSMUST00000183220 416 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Gm37822-201ENSMUST00000192618 1109 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Gm43607-201ENSMUST00000199524 336 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Gm30771-201ENSMUST00000205683 737 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Gm8948-201ENSMUST00000216371 370 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Gm4120-201ENSMUST00000220456 578 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Trap1a-201ENSMUST00000054534 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Gm10490-201ENSMUST00000086274 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Rab25-201ENSMUST00000008745 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Clec3a-201ENSMUST00000009018 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ssxb8B1AY40 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Zcwpw2-201ENSMUST00000111769 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ssxb8B1AY40 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Ighv1-72-201ENSMUST00000103541 396 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ssxb8B1AY40 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ssxb8B1AY40 Gm32921-201ENSMUST00000200592 810 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ssxb8B1AY40 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ssxb8B1AY40 Snora57-201ENSMUST00000093658 148 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ssxb8B1AY40 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ssxb8B1AY40 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ssxb8B1AY40 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssxb8B1AY40 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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