Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Spaca5-201ENSMUST00000040437 640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Ms4a6d-201ENSMUST00000025582 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Disp2-203ENSMUST00000110843 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm37048-201ENSMUST00000194827 5578 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 9630001P10Rik-202ENSMUST00000181335 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Phactr1-214ENSMUST00000149235 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Tgfbi-201ENSMUST00000045173 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Nr2e1-202ENSMUST00000105498 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 AC160931.1-201ENSMUST00000223298 413 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Prune2-207ENSMUST00000225351 2115 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms