Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gnpnat1-202ENSMUST00000226276 710 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Eras-201ENSMUST00000033500 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 1700049L16Rik-201ENSMUST00000049520 543 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Copg1-201ENSMUST00000049966 921 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 9330161L09Rik-201ENSMUST00000056140 999 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Plac8l1-201ENSMUST00000081374 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Epb41l3-215ENSMUST00000225977 3188 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Nfasc-202ENSMUST00000094569 9739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm10608-201ENSMUST00000093527 2509 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm38012-201ENSMUST00000193022 3029 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm43322-201ENSMUST00000196232 1612 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm35608-201ENSMUST00000218472 2370 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 AC156802.2-201ENSMUST00000225239 5740 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Pln-202ENSMUST00000163319 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr1491-204ENSMUST00000216366 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Xpnpep2-203ENSMUST00000115000 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Atp7b-202ENSMUST00000110738 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Dppa1-201ENSMUST00000077173 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm19085-201ENSMUST00000188924 2162 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Pla2g6-202ENSMUST00000166977 3365 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Chd7-202ENSMUST00000051558 10216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Nvl-201ENSMUST00000027797 9392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Pdgfra-208ENSMUST00000202681 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gprasp2-211ENSMUST00000173804 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Itgb2l-201ENSMUST00000000161 2633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm20371-201ENSMUST00000203354 1756 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Ces2b-201ENSMUST00000059449 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Prpf38a-201ENSMUST00000079213 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Cdh16-213ENSMUST00000212882 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Cldn34c1-202ENSMUST00000113348 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Rfxank-201ENSMUST00000075724 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Sec61g-201ENSMUST00000109641 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Ccdc141-203ENSMUST00000111833 631 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gps2-203ENSMUST00000116358 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr122-201ENSMUST00000119082 993 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Mrgpra2b-201ENSMUST00000119798 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm25842-201ENSMUST00000122590 322 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Wdr61-205ENSMUST00000130368 1162 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm12248-201ENSMUST00000137124 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm25736-201ENSMUST00000175165 101 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Mir378b-201ENSMUST00000175244 92 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm26445-201ENSMUST00000177557 109 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm25145-201ENSMUST00000177640 110 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm22347-201ENSMUST00000180276 132 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm29444-201ENSMUST00000187152 1156 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm2694-209ENSMUST00000210935 1125 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Fkbp3-202ENSMUST00000220730 579 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Wdr61-201ENSMUST00000051822 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Clrn2-201ENSMUST00000053250 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm23037-201ENSMUST00000083874 324 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Eya3-201ENSMUST00000020197 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Sorbs2-215ENSMUST00000135336 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gapdhs-201ENSMUST00000074758 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms