Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap4-205ENSMUST00000114407 3051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ash2l-203ENSMUST00000110609 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr169-204ENSMUST00000216070 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Scnn1a-207ENSMUST00000177329 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Mir1964-201ENSMUST00000158514 83 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21370-201ENSMUST00000177659 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21188-201ENSMUST00000178618 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm933-201ENSMUST00000179384 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Mir8110-201ENSMUST00000183771 97 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 250 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 1700109K24Rik-202ENSMUST00000227532 1030 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23973-201ENSMUST00000083320 321 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22054-201ENSMUST00000083395 155 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm826-201ENSMUST00000099127 637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Kif1b-202ENSMUST00000055647 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 R3hdm2-205ENSMUST00000105251 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gskip-201ENSMUST00000051934 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Snap47-201ENSMUST00000010038 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Sec31b-201ENSMUST00000063632 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ankmy1-202ENSMUST00000160548 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Aqp7-201ENSMUST00000030136 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Utp6-201ENSMUST00000043152 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 5830473C10Rik-201ENSMUST00000094615 2308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ebf3-205ENSMUST00000209578 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 AC167565.2-201ENSMUST00000227042 1870 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Irf9-203ENSMUST00000134863 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ttll7-203ENSMUST00000106134 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 AC161117.2-201ENSMUST00000221908 451 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 AC140799.1-201ENSMUST00000228866 787 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Sprr1a-201ENSMUST00000054599 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Kirrel3-205ENSMUST00000187182 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3594-202ENSMUST00000171784 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Cep57l1-205ENSMUST00000187143 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms