Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Rpl23a-ps3-201ENSMUST00000104925 468 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps103-201ENSMUST00000120171 893 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm11953-201ENSMUST00000122352 1003 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Uchl1os-202ENSMUST00000177319 505 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Ly6a-205ENSMUST00000189068 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm43711-201ENSMUST00000195994 373 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm43218-201ENSMUST00000196275 344 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm43709-201ENSMUST00000199870 559 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm34597-201ENSMUST00000211189 633 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm5654-201ENSMUST00000217787 475 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm4739-201ENSMUST00000218296 633 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 AC122539.2-201ENSMUST00000220207 404 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 AC154747.2-201ENSMUST00000225109 780 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 AC167013.6-201ENSMUST00000226587 1067 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 AC164879.1-201ENSMUST00000227904 1021 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Aamdc-201ENSMUST00000042627 627 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm26244-201ENSMUST00000083435 164 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm10335-201ENSMUST00000096020 468 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm10132-201ENSMUST00000099431 468 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gimd1-204ENSMUST00000212804 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm43149-201ENSMUST00000198162 1422 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Ttc26-205ENSMUST00000162554 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Ube2v1-201ENSMUST00000060645 1586 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 1810053B23Rik-204ENSMUST00000185971 1309 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm14427-201ENSMUST00000117183 635 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm12206-201ENSMUST00000119795 601 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm8865-201ENSMUST00000125697 430 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps87-201ENSMUST00000174393 876 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm28609-201ENSMUST00000186515 463 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm9142-201ENSMUST00000187161 955 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Scgb1b9-ps-201ENSMUST00000191567 266 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm30835-201ENSMUST00000198825 689 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm45901-201ENSMUST00000203807 661 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 AC153937.2-202ENSMUST00000219583 670 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 AC159649.1-201ENSMUST00000220851 977 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Ghrh-201ENSMUST00000029172 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Mas1-201ENSMUST00000089015 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm36799-201ENSMUST00000214113 1737 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Glcci1-202ENSMUST00000161217 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Zscan22-202ENSMUST00000117189 2995 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Vmn2r40-201ENSMUST00000171942 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 D7Ertd443e-201ENSMUST00000094002 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms