Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm13081-201ENSMUST00000121527 5599 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Cd300lb-203ENSMUST00000149663 2641 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Unc79-208ENSMUST00000179002 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SrprbP47758 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SrprbP47758 4930471M09Rik-202ENSMUST00000206475 1990 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
SrprbP47758 AC162467.2-201ENSMUST00000219397 2571 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
SrprbP47758 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SrprbP47758 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Icosl-201ENSMUST00000105393 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm28852-201ENSMUST00000186666 2160 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm28880-201ENSMUST00000190161 2160 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Nip7-201ENSMUST00000034392 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Rgs8-204ENSMUST00000111814 678 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm26469-201ENSMUST00000116765 121 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm42997-201ENSMUST00000196074 918 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm42959-201ENSMUST00000202184 212 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 AC154307.1-201ENSMUST00000214799 90 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm28352-201ENSMUST00000186654 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm29654-201ENSMUST00000186886 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm28226-201ENSMUST00000186916 2169 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm29302-201ENSMUST00000187209 2167 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm28866-201ENSMUST00000187298 2167 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm28878-201ENSMUST00000188272 2167 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm28246-201ENSMUST00000188308 2167 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm28823-201ENSMUST00000188540 2167 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm29046-201ENSMUST00000188653 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm28346-201ENSMUST00000189021 2167 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Nkrf-201ENSMUST00000057093 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm37980-201ENSMUST00000194420 1910 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Kyat3-201ENSMUST00000044392 4206 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm9399-201ENSMUST00000175771 639 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gstp3-202ENSMUST00000189808 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm36996-201ENSMUST00000194466 250 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms