Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Olfr298-201ENSMUST00000077800 999 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Csnk1g1-209ENSMUST00000205379 4001 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Duxbl2-201ENSMUST00000100810 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Ankrd45-202ENSMUST00000111608 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 AC154482.1-201ENSMUST00000223248 2483 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
P20040 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Pax9-201ENSMUST00000001538 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Sla-205ENSMUST00000168589 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm17027-201ENSMUST00000171202 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 CT009530.1-201ENSMUST00000227348 2927 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm43409-201ENSMUST00000195921 2162 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm5721-201ENSMUST00000119845 1696 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm7682-202ENSMUST00000202916 1582 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm12142-201ENSMUST00000117114 485 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm12861-201ENSMUST00000145395 681 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm43518-201ENSMUST00000166129 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm20511-201ENSMUST00000174079 456 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm26977-201ENSMUST00000183151 996 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 1700019P21Rik-201ENSMUST00000186955 411 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm29144-201ENSMUST00000189235 339 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm29238-201ENSMUST00000189709 695 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 1700029J03Rik-202ENSMUST00000189879 712 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm28607-201ENSMUST00000190142 339 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm28530-201ENSMUST00000190473 577 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm7482-201ENSMUST00000206446 505 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Vmn2r-ps91-201ENSMUST00000213039 784 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 CT033774.2-201ENSMUST00000222079 256 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 AC126691.2-201ENSMUST00000226185 249 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 AC167019.4-201ENSMUST00000226494 1070 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 AC171241.2-201ENSMUST00000228744 892 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Guca2a-201ENSMUST00000024015 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Prb1-201ENSMUST00000087853 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 1700074P13Rik-202ENSMUST00000122181 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
P20040 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Slc16a4-202ENSMUST00000106723 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Zranb1-201ENSMUST00000033265 2210 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Enpp4-202ENSMUST00000143137 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 AC132384.4-201ENSMUST00000220343 1397 ntBASIC7□□□□□ -1.29
P20040 A330076C08Rik-202ENSMUST00000223513 1937 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Zfp607b-201ENSMUST00000076421 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm35147-201ENSMUST00000208383 1820 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Igkv6-25-201ENSMUST00000103383 380 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm26344-201ENSMUST00000104553 132 ntBASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Olfr639-201ENSMUST00000106862 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm13218-201ENSMUST00000128180 265 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 1700092C02Rik-201ENSMUST00000134397 359 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Rubie-201ENSMUST00000151828 1137 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Olfr457-201ENSMUST00000170504 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
P20040 Gm5977-201ENSMUST00000174304 573 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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