Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Nrxn3-202ENSMUST00000110130 3654 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm26633-201ENSMUST00000180546 3256 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Zfp961-201ENSMUST00000109997 2713 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC161117.1-201ENSMUST00000221366 1529 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Syne1-202ENSMUST00000095899 3443 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr923-203ENSMUST00000213619 2846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Pgk2-201ENSMUST00000033585 1592 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Fbxl2-201ENSMUST00000035090 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Zfp248-201ENSMUST00000069292 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr1110-202ENSMUST00000152758 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Trappc12-202ENSMUST00000168129 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Cyp2c50-202ENSMUST00000080171 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr381-203ENSMUST00000214623 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Nrg4-213ENSMUST00000164721 1927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr117-203ENSMUST00000215414 3498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Klhl5-201ENSMUST00000101191 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Satb1-203ENSMUST00000129667 2896 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Aldoart1-202ENSMUST00000179234 2050 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Ighv1-59-201ENSMUST00000103530 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Ighv1-82-201ENSMUST00000103549 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm25501-201ENSMUST00000104429 132 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr329-ps-202ENSMUST00000108823 1060 ntAPPRIS P2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm11241-201ENSMUST00000117371 896 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Mageb7-ps-201ENSMUST00000118274 1041 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm12170-201ENSMUST00000119281 300 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm12297-201ENSMUST00000121380 979 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm14830-201ENSMUST00000121899 700 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Apoc2-202ENSMUST00000134116 569 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm15849-201ENSMUST00000159257 335 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm17053-201ENSMUST00000163501 495 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Slc35a5-205ENSMUST00000181177 865 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Anks1b-209ENSMUST00000182083 416 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm18353-201ENSMUST00000185906 784 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm32916-201ENSMUST00000207884 935 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Anapc15-ps-202ENSMUST00000218771 399 ntAPPRIS P5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC139381.1-201ENSMUST00000224215 478 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Rpsa-ps2-201ENSMUST00000059546 880 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm10490-201ENSMUST00000086274 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Klf10-201ENSMUST00000074043 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 1700095J07Rik-201ENSMUST00000128017 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Msr1-201ENSMUST00000026021 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 C6-201ENSMUST00000022788 2447 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Chrdl2-202ENSMUST00000107084 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Zfp791-201ENSMUST00000098550 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm37065-203ENSMUST00000192498 1622 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm37409-201ENSMUST00000195811 1626 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm14668-201ENSMUST00000118588 1724 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Cep112-216ENSMUST00000182729 2850 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Cphx3-202ENSMUST00000184577 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Bicc1-202ENSMUST00000131445 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Naa20-204ENSMUST00000134759 1883 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 4930428N03Rik-204ENSMUST00000224456 3212 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gem-201ENSMUST00000029868 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Palb2-203ENSMUST00000106468 3304 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms