Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm4120-201ENSMUST00000220456 578 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 AC154528.3-201ENSMUST00000228011 679 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Cyhr1-202ENSMUST00000081291 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm45237-202ENSMUST00000211157 2452 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 A530064D06Rik-202ENSMUST00000053612 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm24335-201ENSMUST00000104211 132 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm12861-201ENSMUST00000145395 681 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm24039-201ENSMUST00000157878 132 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm16585-201ENSMUST00000161442 610 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm8686-201ENSMUST00000203028 388 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm32710-201ENSMUST00000210677 618 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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H2-Eb1P04230 A930040O22Rik-201ENSMUST00000221662 973 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
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H2-Eb1P04230 AC122877.1-201ENSMUST00000228873 218 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm44187-201ENSMUST00000204735 1929 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Smok2b-202ENSMUST00000162940 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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H2-Eb1P04230 Zbtb26-202ENSMUST00000102789 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 D130007C19Rik-201ENSMUST00000067277 1505 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm23131-201ENSMUST00000104253 132 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm23946-201ENSMUST00000104423 197 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm2237-201ENSMUST00000112595 471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm23840-201ENSMUST00000116950 97 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm17033-201ENSMUST00000146663 593 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm25190-201ENSMUST00000176664 95 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm12424-201ENSMUST00000179673 447 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm44588-201ENSMUST00000208401 545 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm35501-202ENSMUST00000215101 459 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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