Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 1700034I23Rik-201ENSMUST00000099123 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm5535-208ENSMUST00000210482 1403 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hps1O08983 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm11239-201ENSMUST00000171348 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm11237-201ENSMUST00000178319 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm11236-201ENSMUST00000180092 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm428-201ENSMUST00000084475 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm11238-201ENSMUST00000084479 1323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Fignl1-201ENSMUST00000047689 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Slc30a6-201ENSMUST00000024870 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Asb14-203ENSMUST00000165929 1817 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm14994-201ENSMUST00000117482 1092 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Rasgef1b-207ENSMUST00000166484 1296 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm3654-201ENSMUST00000173038 909 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Zfp738-204ENSMUST00000175678 609 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm42538-201ENSMUST00000196233 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm3854-201ENSMUST00000207173 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm2915-201ENSMUST00000222565 787 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Ccl17-201ENSMUST00000034232 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Lgals9-202ENSMUST00000108268 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Abhd12b-206ENSMUST00000182927 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm7364-201ENSMUST00000188760 1501 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Ms4a4d-201ENSMUST00000025581 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm11870-201ENSMUST00000119255 1322 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gzmk-202ENSMUST00000122399 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Slc31a1-201ENSMUST00000084526 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 AC122887.1-201ENSMUST00000219265 2722 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Il5ra-201ENSMUST00000167925 1704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm43942-201ENSMUST00000204522 2859 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Olfr444-202ENSMUST00000204092 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Aldh18a1-207ENSMUST00000176939 3427 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 2310005A03Rik-201ENSMUST00000142569 1398 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 AC100590.1-201ENSMUST00000220318 1357 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Cdh26-201ENSMUST00000042092 2891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm5721-201ENSMUST00000119845 1696 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 n-R5s102-201ENSMUST00000101990 119 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm25607-201ENSMUST00000104020 127 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm12917-201ENSMUST00000119850 639 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm14200-201ENSMUST00000122256 192 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm15742-201ENSMUST00000123905 659 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Kcnab3os-201ENSMUST00000136196 566 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Scamp1-204ENSMUST00000153558 1255 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm24327-201ENSMUST00000175108 78 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 n-R5s101-201ENSMUST00000177910 119 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 n-R5s114-201ENSMUST00000178297 119 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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