Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hdac5Q9Z2V6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
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