Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac6Q9Z2V5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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