Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2T6

Krt85, Keratin, type II cuticular Hb5, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt85Q9Z2T6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt85Q9Z2T6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt85Q9Z2T6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms