Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I0

Letm1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm1Q9Z2I0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Letm1Q9Z2I0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Letm1Q9Z2I0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Letm1Q9Z2I0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Letm1Q9Z2I0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Letm1Q9Z2I0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms