Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd1Q9Z2E2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd1Q9Z2E2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms