Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip6Q9Z1Y4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip6Q9Z1Y4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip6Q9Z1Y4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip6Q9Z1Y4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms