Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna2d3Q9Z1L5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna2d3Q9Z1L5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms