Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms