Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slfn1Q9Z0I7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms