Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stxbp4Q9WV89 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms