Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms