Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms