Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn5Q9WU28 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn5Q9WU28 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms