Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nrf1Q9WU00 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms