Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Usp18Q9WTV6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Usp18Q9WTV6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Usp18Q9WTV6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Usp18Q9WTV6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Usp18Q9WTV6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Usp18Q9WTV6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp18Q9WTV6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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Usp18Q9WTV6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Usp18Q9WTV6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Usp18Q9WTV6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Usp18Q9WTV6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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