Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6cQ9WTM3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms