Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plod1Q9R0E2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms