Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lamc3Q9R0B6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Lamc3Q9R0B6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Lamc3Q9R0B6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms