Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp11cQ9QZW0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms