Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas3Q9QZQ0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms