Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms